Thèse Rôle des Protéines Plant Mobile Domain dans la Formation de l'Épiderme Barrière Protective des Plantes. H/F - 66

Établissement : Université de Perpignan Via Domitia
École doctorale : Energie et Environnement
Laboratoire de recherche : Laboratoire Génome et Développement des Plantes
Direction de la thèse : Guillaume MOISSIARD ORCID 0000000295326876
Début de la thèse : 2026-07-01
Date limite de candidature : 2026-04-07T23:59:59

Chez les plantes, le périderme est un tissu recouvrant divers organes tels que les racines, les tiges, les tubercules ou certains fruits qui protège les tissus internes contre les intrusions ou la déshydratation. Il joue ainsi un rôle essentiel dans l'adaptation des plantes à un environnement changeant. Sa formation repose sur l'expression précise de réseaux de gènes, étroitement régulés au niveau de la chromatine par de nombreux facteurs. Parmi ceux-ci, des facteurs de transcription spécifiques (TFs) et des voies épigénétiques, telles que le 'Polycomb repressive complex 2' (PRC2), impliqué dans le dépôt de groupes méthyles sur l'histone H3 au niveau de la lysine 27 (H3K27me3), jouent des rôles cruciaux.Récemment, la protéine nucléaire d'Arabidopsis AtMAINTENANCE OF MERISTEMS-LIKE 2 (AtMAIL2), qui possède un domaine de type PMD, a été identifiée comme essentielle au développement des plantes. AtMAIL2 est nécessaire à l'expression de nombreux gènes en antagonisant l'activité du PRC2. Bien qu'AtMAIL2 et ses homologues soient exprimées dans les tissus méristématiques (cellules souches), leur rôle dans la formation du périderme reste inconnu. L'objectif de ce projet de thèse sera de répondre à cette question en étudiant la fonction d'AtMAIL2 et de ses homologues dans la formation du périderme racinaire chez Arabidopsis. Il s'agira également d'étudier la fonction encore inconnue de StPMD2, l'orthologue d'AtMAIL2 chez la pomme de terre (Solanum tuberosum), et de déterminer s'il joue un rôle dans la formation du périderme du tubercule de pomme de terre. Ce projet de thèse combinera des approches de biologie moléculaire, biochimie, microscopie et (épi)génomique, couplées à des analyses bioinformatiques, afin de mieux comprendre le rôle des protéines PMD dans le processus de formation du périderme.

Plant mobile domain (PMD) proteins are chromatin factors that are required for the proper development of the model plants Arabidopsis. In several pmd mutants, several developmental defects are observed, and hundreds of genes are misregulated. Recently, we showed that PMD proteins are preferentially localized within the promoter of several genes carrying specific DNA motifs. In the pmd mutants, significant fractions of PMD-targeted genes are downregulated due to the ectopic deposition of the epigenetic mark H3K27me27 that is deposited by the Polycomb pathway. Thus, this demonstrates that in Arabidopsis, PMD proteins secure gene expression by antagonizing he Polycomb pathway.

Deciphering the function of PMD proteins during periderm formation in two different plant systems,

Molecular biology, cloning, plant transformation
Phenotyping
RNA extraction, RT-QPCR
Western blots
Optical and confocal microscopy
RNA-sequencing
Bioinformatic analyses