Thèse Impact de l'Hypoxie sur l'Interaction Entre l'Huître Magallana Gigas et la Bactérie Vibrio Aestuarianus H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Perpignan Via Domitia École doctorale : Energie et Environnement Laboratoire de recherche : Interactions Hôtes-Pathogènes Environnements Direction de la thèse : Marie-Agnès TRAVERS ORCID 0000000153407435 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-07-15T23:59:59 Au cours des dernières décennies, la fréquence des maladies affectant les animaux n'a cessé d'augmenter. Le changement global et la pollution contribuent largement à cette augmentation. L'huître Magallana gigas, première espèce de coquillage élevée en France, n'est pas épargnée par l'émergence de ces maladies. Depuis 2001, les ostréiculteurs font face à des épisodes de mortalité successifs d'huîtres, causés par des agents pathogènes émergents, que ce soit dans la lagune de Thau (Occitanie) mais également partout en Europe. Parmi eux, Vibrio aestuarianus est une bactérie pathogène, décrite depuis 2001 en France, induisant une maladie sous contrôle de l'environnement [1]. Cette maladie entraîne des mortalités comprises entre 25 et 70 %, avec un impact économique majeur, car elle affecte des huîtres adultes de taille commercialisable, élevées depuis plusieurs années [2].
L'augmentation des épisodes d'hypoxie en zone côtière constitue un facteur de stress majeur pour l'huître Magallana gigas et pourrait favoriser l'expression de la virulence de bactéries opportunistes, dont Vibrio aestuarianus. L'objectif de la thèse est d'identifier comment la baisse d'oxygène dissous modifie (i) le développement de cette maladie, (ii) les déterminants de virulence de la bactérie, et (iii) la sensibilité/physiologie de l'huître afin d'intégrer ces résultats pour proposer des indicateurs de risque et des pistes prophylactiques utiles à la gestion durable de l'ostréiculture. Le projet combine des infections expérimentales sous conditions d'oxygénation contrôlée, des mesures physiologiques et immunitaires chez l'hôte, l'analyse des facteurs sécrétés par la bactérie et l'exploitation statistique/biologique des données, avec une valorisation progressive (communications en congrès, publications scientifiques). Les travaux de thèse concernent le domaine des interactions hôte-pathogène-environnement en se focalisant sur la régulation de la virulence de la bactérie Vibrio aestuarianus, pathogène d'huître, et de la réponse métabolique et immunitaire de son hôte, l'huître Magallana gigas. Depuis des décennies, l'huître creuse d'intérêt économique M. gigas subit des mortalités mais la sévérité de ces épisodes a dramatiquement augmenté ces 20 dernières années. Une des maladies responsables de ces mortalités affecte les huîtres adultes commercialisables [1]. Récemment, l'agent aetiologique de cette maladie (la bactérie Vibrio aestuarianus) a pu être retrouvé dans de nombreux pays européens [2]. Les travaux de recherche effectués dans l'unité IHPE sont consacrés à la compréhension de l'étiologie complexe de cette maladie. L'objectif de ces travaux de thèse est d'identifier comment la baisse de l'oxygène dissous dans l'eau de mer modifie l'interaction entre l'huître Magallana gigas et la bactérie pathogène Vibrio aestuarianus. Le projet visera plus précisément à déterminer ses effets sur :
(i) le développement de la maladie associée à Vibrio aestuarianus;
(ii) les déterminants de virulence, notamment les protéines sécrétées;
(iii) la sensibilité et la physiologie de l'huître.
L'intégration de ces résultats permettra de proposer des indicateurs de risque et des pistes prophylactiques utiles à la gestion durable de l'ostréiculture. Bactériologie classique, méthodes de biologie moléculaire, infections expérimentales, étude transcriptomique par RNA-seq et RT-qPCR, bioinformatique

formation en microbiologie, écologie microbienne ou biologie moléculaire ; intérêt pour les approches interdisciplinaires, omiques et analyses.